KilaFlow ставит игрока под контроль игрушечного робота-антивируса по имени Кила. Персонаж перемещается по системе Datyte с задачей остановить вирусное заражение. Для продвижения по различным программам и мирам геймеру предстоит прыгать, скользить и вращаться. Основной геймплей заключается в генерации Ключекамней для открытия путей и взаимодействии с местными существами для их исцеления. В конечном счете Кила должен отыскать девять ключей от каждой программы, получая доступ к источнику заражения.

Игровой опыт в KilaFlow разделен на 7 миров, каждый из которых содержит 9 отдельных этапов и завершается столкновением с боссом. Решения геймера имеют последствия; спасение поврежденных данных является одним из вариантов, тогда как их игнорирование приводит к появлению более сильных противников в локациях. Главная задача — добраться до Золотых Скобок, подобрать ключ и одолеть вирус, делая остальные цели второстепенными. Эти цифровые полосы препятствий предлагают разнообразные сценарии: от навигации в программе для виртуального питомца до входа в сервис для знакомств с персонажами, делающими откровенные предложения.

Прочие миры включают вейпорвейв-бухту с дельфином, пустыню с динозаврами в вагонах поездов и локацию, созданную из интернет-рекламы. Геймеры, превосходящие установленное время прохождения этапов, получают улучшенные артефакты, в свою очередь открывающие доступ к секретам. Такие механики допускают разные подходы, будь то концентрация на скорости, сборе предметов или простом достижении финала. Конечная цель игры — использовать собранные предметы для противостояния угрозе.