Caput Mortum предлагает игроку спуститься в башню алхимика во Франции XVI века для исследования её таинственных глубин. Перемещение от первого лица по забытым кошмарам строения сопряжено с риском, а основные действия сводятся к противостоянию ужасам и раскрытию секретов запретных знаний. Для продвижения вглубь необходимо внимательно изучать окружение, чтобы восстановить картину произошедших в башне событий и решить уникальные головоломки, встречающиеся на каждом шагу.

В Caput Mortum кошмарные создания бродят по заброшенным залам и без колебаний нападают. Геймеру предстоит сохранять бдительность, используя скрытность для обхода этих сущностей, вступая в бой или находя иные решения. Здоровье — критически важный ресурс, поскольку лечебные предметы намеренно сделаны редкими, что является отсылкой к старым игровым проектам на выживание. Каждая дверь способна скрыть новый кошмар, а любой угол — ключ к эзотерической тайне, требуя от геймера постоянной осмотрительности.

Эта игра погружает в мрачный мир, где напряжение нарастает со временем. Внимание к деталям локаций становится решающим фактором для преодоления уникальных загадок и перемещения по комнатам башни. Пристально изучая всё вокруг, протагонист восстанавливает последовательность случившихся событий. Главный вызов тайтла заключается в том, как далеко персонаж готов зайти в глубины строения и какие жуткие реалии он в итоге обнаружит, продвигаясь всё дальше по забытому месту.