Battle Train сочетает в себе механики сбора колоды и тактические железнодорожные сражения на разделенной на клетки карте. Игроки прокладывают пути от своей станции, чтобы добраться до базы вражеского машиниста. Для победы необходимо физически уничтожить штаб соперника, чего можно достичь, применяя различные локомотивы и вспомогательные средства из своей колоды. Карты позволяют проводить прямые атаки, запускать взрывоопасные составы и активировать природные катаклизмы, чтобы помешать действиям оппонента.

Эта игра представляет собой соревнование, которое транслируется в эфире, где геймеры сражаются за главный титул. На пути к финалу предстоит столкнуться с чередой оппонентов на множестве этапов, и каждый из них обладает особыми наборами карт и способностями, формирующими их тактику. Сюжетная линия Battle Train повествует о продвижении по турнирной сетке. Успех зависит от умения перехитрить соперников, используя грамотное размещение путей и эффективное разыгрывание карт для продвижения к заключительному поединку.

Геймплей дает возможность настраивать основной локомотив при помощи набора улучшений, дающих определенные функции во время матча. Основа любой стратегии заключается в составлении колоды из ассортимента доступных карточек, каждая из которых предназначена для нападения или контроля над полем. Весь игровой процесс построен на отдельных поединках и специальных событиях, предлагающих уникальные испытания и награды за их выполнение. Противостояние с разными машинистами требует адаптации, поскольку их уникальные арсеналы создают разнообразные тактические ситуации на поле боя.