Mistified представляет собой головоломку, сосредоточенную на навигации по сеточным локациям на многочисленных островах. Игрокам предстоит решать задачи, включающие манипуляцию объектами и поиск пути, действуя с видом сверху. Основная цель — направлять души существ через взаимодействие с окружением, определяя их маршрут действиями персонажа. Успешное выполнение этих заданий способствует достижению главной сюжетной линии — возвращению потерянных специй и возвращению домой.

В Mistified геймеры перемещаются между зонами с загадками, управляя определенным персонажем-кроликом на интерфейсе большой карты. Игровой процесс включает использование звуков окружения, таких как шаги протагониста, для влияния на перемещение созданий к обозначенным безопасным участкам или подальше от опасностей. Предстоит также напрямую взаимодействовать с элементами вроде духовного тумана, который способен перемещать предметы, или его поток можно перенаправить для изменения планировки уровней.

Устранение преград включает действия наподобие топтания темных когтей, блокирующих пути, необходимые для продвижения вперед. Эта игра содержит 150 отдельных головоломок, построенных из комбинации интерактивных компонентов. Геймерам доведется столкнуться с 5 различными типами животных, каждый из которых обладает уникальными моделями поведения и особенностями взаимодействия с миром или другими элементами. Решения часто требуют управления 3 различными разновидностями бревен, включая стандартные и поляризующие варианты, наряду с необходимостью обходить ловушки, предназначенные для препятствования существам.