Flutter Away отправляет специалиста по бабочкам в пятидневную экспедицию вглубь амазонских джунглей. Разбив лагерь, геймер приступает к основной задаче — изучению окрестных тропинок в собственном темпе. Цель этого короткого приключения состоит в наблюдении и документировании разнообразных форм жизни региона. Всё путешествие представляет собой уединённую миссию, сфокусированную на научных открытиях и ограниченную продолжительностью поездки.

Игровой процесс Flutter Away строится на наблюдении и ведении записей от первого лица. Игрокам предстоит систематически осматривать окружение в поисках конкретных объектов: грибов, лягушек, цветов и, конечно, бабочек. Каждая находка фотографируется при помощи камеры. Полученные снимки попадают в полевой журнал, раскрывающий дополнительные сведения о каталогизированных образцах. Такой подход мотивирует к тщательному исследованию местности для обнаружения всех целей.

Кроме каталогизации флоры и фауны, героиня вступает во взаимодействие с некоторыми животными. Ключевой элемент сюжета — налаживание контакта с капибарой для раскрытия её секрета. Неотъемлемой частью мира стали природные детали вроде водопада и цикла смены дня и ночи с закатами и звёздным небом. Вся эта игра посвящена времени, проведённому протагонистом наедине с природой за выполнением научных задач в течение пятидневной поездки.