Stone Guardian погружает в историю о древнем страже, пробудившемся от долгого сна из-за пропажи могущественного Камня. Вскоре выясняется, что артефакт похитил давний недруг, выждавший тысячелетие для реализации своего плана. Антагонист намерен присвоить мощь реликвии в момент её пика, случающегося раз в 1000 лет, и стать непобедимым. Герой вынужден отправиться в полное опасностей путешествие по магическому измерению, чтобы вернуть артефакт и предотвратить катастрофу вселенского масштаба.

Продвижение по сюжету Stone Guardian потребует от игрока сражаться с агрессивными существами и могущественными боссами. Важной частью геймплея является система развития персонажа, завязанная на поиске камней навыков. Геймеры могут выполнять второстепенные задания или исследовать мир в поисках этих особых предметов, дарующих очки для улучшения способностей. Разгадывание головоломок и выполнение разнообразных задач открывают доступ к новым локациям, позволяя продвигаться дальше по истории этой игры.

События проекта разворачиваются в двух параллельных реальностях: в обычном мире людей и в полном магии измерении. Последнее населено необычными созданиями, а попасть туда можно лишь через специальные порталы. Изначально могущественный артефакт был сокрыт в человеческой реальности для сохранения хрупкого равновесия вселенной, а главный герой является его вечным стражем. Цель антагониста — разрушить эту гармонию, захватив контроль над обоими мирами и подчинив их своей воле.