Soul Apocalypto — это ролевая игра, которая включает в себя системы из нескольких стратегических поджанров. Геймплей объединяет командные бои с коллекционированием существ и некоторыми механиками сбора колод, с видом как сверху, так и от третьего лица. Основное занятие — призыв различных компаньонов для создания персонализированного боевого отряда. Прогресс напрямую зависит от выбора этих бойцов и их компоновки в группу, способную исследовать открытый мир.

Данный процесс требует учитывать потенциальный вклад каждого юнита в общее дело. Игровой процесс в Soul Apocalypto сосредоточен на тактическом размещении призванных бойцов. Каждый персонаж обладает набором умений, и геймер должен распределить эти способности, определяя тактические характеристики команды и общий подход к сражению. Такая настройка позволяет создавать специализированные отряды, рассчитанные на разные сценарии и столкновения с противниками. Метод распределения навыков напрямую влияет на эффективность группы против разнообразных оппонентов.

Решения, принятые при формировании отряда, становятся фундаментом для преодоления всех дальнейших испытаний. Главная цель игрока — одолеть череду врагов и противостоять боссам, преграждающим дальнейшее продвижение. Сражения используют тактику в реальном времени и могут содержать элементы автобоя, делая первоначальную настройку команды ключевым элементом взаимодействия. Адаптация состава отряда и набора умений его участников становится постоянной необходимостью для сокрушения обороны каждого нового неприятеля.