Действие Rewrite Harvest festa! разворачивается в Кадзамацури, городе, построенном на принципе сосуществования цивилизации и природы. Здесь протагонист Тэннодзи Котаро проводит дни вместе с друзьями Канбэ Котори и Ёсино Харухико. Основы города раз в год сотрясает масштабное событие — Праздник урожая. Котаро использует этот повод для сбора сведений о слухах касательно неопознанных существ и оккультизма. Эта деятельность совпадает с чередой необъяснимых происшествий, начинающих случаться с самим протагонистом.

Он принимает предложение от Сэнри Аканэ, президента Общества изучения оккультизма, помочь в расследовании, вовлекающем его одноклассников. Для Котаро это становится периодом активной деятельности и исследований в компании энергичной группы людей. События Rewrite Harvest festa! в итоге показывают, что его личное приключение связано с поиском еще никем не открытой истины. Стержень повествования строится вокруг возможности изменить предначертанный путь другого человека. Это путешествие раскрывает связи между ним и людьми, с которыми он познакомился в обществе.

Этот проект предлагает 6 открываемых веток повествования, каждая посвящена одной из героинь. Решения игрока ведут к множеству выборов, приводящих к различным финалам для каждого пути персонажа. После завершения всех сюжетных линий игроку становится доступна мини-игра в жанре исследования подземелий от первого лица под названием Rewrite Quest. Прохождение сюжетных сегментов также открывает просмотрщик изображений и режим воспроизведения музыки, предоставляя доступ к материалам, встречающимся на протяжении всей игры.