Michelangelo: Stonemason Simulator ставит игрока на место художника эпохи Возрождения, начиная примерно с 1495 года. С видом от первого лица вы будете напрямую взаимодействовать с воксельными каменными блоками, методично придавая им форму с помощью долота. Каждый отколотый от глыбы фрагмент приносит очки опыта. Эти баллы вкладываются в систему навыков, открывая новые способности и техники для обработки материала. Весь геймплей сфокусирован на ремесле, без временных лимитов или условий поражения — только вы и камень.

Структура этого симулятора строится на серии из 8 линейных заданий, которые освещают часть карьеры мастера. Цели в Michelangelo: Stonemason Simulator постепенно усложняются, начиная с создания простой колонны. По мере прокачки умений сложность проектов возрастает, подводя к созданию полноразмерной скульптуры Давида. Это путешествие рассчитано на одного игрока и предлагает продвижение по заранее определенной цепочке событий, где каждое завершенное произведение открывает следующий этап.

В ходе миссий предстоит взаимодействовать с другими деятелями той эпохи, включая персонажа по имени Изабелла, которая представлена как сестра Леонардо да Винчи. Ее кот Гнокки также появляется во время этих встреч. Эти взаимодействия вплетены в процесс выполнения ремесленных поручений. Повествование служит основой для основной деятельности — добычи сырья и применения физики для его превращения в конкретные формы. Вся игра представляет собой самодостаточный опыт и следует по заданному пути от начала до финала.