NABOKI начинается с неподвижной конструкции, размещённой в центре экрана. Задача геймера — не строить или собирать, а разбирать. Каждый уровень — это абстрактная фигура, собранная из геометрических элементов. Чтобы пройти дальше, необходимо определить, какие части можно выдвинуть, и в каком порядке это сделать. Подсказки отсутствуют. Все действия зависят от наблюдательности: нужно учитывать форму, направление и возможные траектории.

Во вселенной NABOKI механика основана на взаимодействии форм. Элементы двигаются, вращаются, разъединяются методом проб и проверок. В проекте нет очков, таймеров и объяснений — всё сосредоточено на работе с объектом. Основная цель — полностью очистить экран от составных компонентов. Игрок двигается по уровням без внешнего давления и ограничений. С каждым новым заданием вводятся другие принципы. Иногда элементы начинают двигаться по непривычным осям, появляются новые способы взаимодействия.

Управление остаётся простым, но для продвижения требуется всё больше внимания. При ошибке можно мгновенно откатить действие, а возврат всегда доступен. Всё пространство вокруг объекта остаётся статичным — фокус держится только на центральной фигуре. Тайтл не использует текст, цифры или визуальные подсказки. Всё строится на движении, пробах и реакциях. Пользователь сам задаёт темп. Никаких временных рамок или санкций за повторение действий нет. Задания открываются последовательно, без возможности пропуска. Чтобы перейти к следующему, нужно полностью освободить конструкцию от всех элементов.