BLUE WISH DESIRE представляет собой 2D скролл-шутер с вертикальной прокруткой. Геймеру предстоит вести свой корабль вверх, противостоя волнам противников, появляющихся в верхней части экрана. Основная задача — маневрировать сквозь плотный вражеский огонь, известный как заградительный или паттерны пуль. Одновременно нужно выцеливать и ликвидировать наступающие угрозы для расчистки пути вперед. Выживание зависит от точных перемещений и предугадывания атак неприятеля на всей площади.

Важной частью геймплея в BLUE WISH DESIRE является система автоматической защиты. Эта механика срабатывает сама, нейтрализуя некоторые летящие снаряды, попадание которых привело бы к проигрышу. Ее наличие призвано снизить порог вхождения, свойственный поджанру буллет-хелл. Игрокам, испытывающим трудности с интенсивным уклонением, такая оборонительная поддержка может помочь.

Система таким образом корректирует кривую сложности, присущую схожим проектам, делая продвижение менее сложным. Задачи этого тайтла шире простого выживания под постоянным натиском оппонентов на уровнях. Ликвидация антагонистов напрямую содействует прохождению этапов и влияет на итоговый счет. Геймеры сталкиваются с различными типами врагов и их построениями по мере углубления в игровой процесс. Эффективная реакция на меняющиеся условия боя составляет основу вовлеченности, которую требует эта игра.