Darkwater дает геймерам командовать подводной лодкой, оказавшейся в ледяной ловушке на чужой планете. Это кооперативный хоррор, рассчитанный на совместную работу от 1 до 4 человек. Выживание подразумевает навигацию во враждебной среде, столкновения с вражескими судами и подводными формами жизни, а также активный поиск ресурсов, нужных для дальнейшей работы субмарины. Успех зависит от выполнения необходимых действий для существования в подледных условиях.

В Darkwater предстоит управлять настраиваемым подводным аппаратом в замерзших глубинах спутника иной планеты, действуя в одиночку или в составе команды. До 4 человек могут сформировать экипаж для противостояния многочисленным глубоководным угрозам, которые представляет этот проект. Деятельность включает морские сражения с другими субмаринами и швартовку собственного судна к заброшенным аванпостам для поиска припасов. Завязка сюжета связана со вспышкой болезни на планете, из-за чего власти заморозили поверхность океана, тем самым заперев команду под слоем льда.

Запасы в подводном мире ограничены, что заставляет экипажи добывать топливо и перемещаться между аванпостами. Необходимо обнаруживать и обследовать ветхие подводные комплексы пешком, собирая любые ценные материалы внутри этих конструкций. Подобные вылазки сопряжены с риском, ведь команды могут встретить различных противников, включая зараженных водолазов, глубоководных удильщиков и инопланетных крабов, таящихся в руинах. Для разрешения таких ситуаций доступен арсенал, включающий кувалды, паяльные лампы, пистолеты и дробовики; скоординированные усилия требуются для доставки канистр с топливом обратно на подлодку.