GIRLS MADE PUDDING повествует о двух героинях, которые исследуют череду опустевших городов. Для передвижения по локациям, откуда пропали люди, они используют мотоцикл. Сюжет раскрывает идею зависимости существования от наблюдения, выраженную фразой: Когда некому тебя видеть, ты исчезаешь. Геймеры сопровождают пару в поездках, узнавая детали этого мира.

Центральный элемент геймплея в GIRLS MADE PUDDING — само путешествие, а не прибытие в пункт назначения. Развитие истории и диалоги происходят преимущественно во время езды на мотоцикле. Остановки прерывают прогресс, поэтому постоянное движение требуется для запуска бесед между героинями и выяснения обстоятельств происходящего. Такая структура подталкивает к безостановочной езде ради знакомства с историей. В пути предстоит находить разбросанные по округе ингредиенты.

Эти предметы активируют систему кулинарии, где созданная еда влияет на сюжет. Поглощение конкретных кушаний открывает новые диалоговые ветки для протагонисток, возможно, соответствующие текущей атмосфере или событиям. Можно экспериментировать с разными рецептами, обнаруженными во время исследования местности. Элементы выживания также являются частью игрового процесса. Героини со временем проголодаются, что требует следить за их питанием, хотя эту особенность можно отключить в настройках сложности.