Fill Up The Hole ставит игрока в роль надзирателя антиутопического поселения, выстроенного вокруг единственной экономической деятельности: превращения отходов в прибыль. Население пеонов самостоятельно собирает мусор для сброса в центральную яму — этот процесс генерирует ресурсы для роста. Основная задача заключается в постройке и расширении деревни, а также стратегическом размещении сооружений для увеличения объемов производства мусора и его последующей утилизации.

По мере масштабирования операции сам поселок развивается, открывая новые функции и визуальные изменения, отражающие его растущую продуктивность. Конечная цель — создание автоматизированной системы менеджмента отходами для извлечения финансовой выгоды. Углубленный менеджмент в Fill Up The Hole требует от геймера взаимодействия с несколькими системами прогрессии для оптимизации своей деятельности. В проекте есть 10 уникальных типов построек, а их расположение и очередность возведения напрямую влияют на эффективность генерации ресурсов.

Древо навыков предлагает сеть апгрейдов, позволяя усиливать производительность зданий и совершенствовать способности пеонов. Посредством этой механики можно получать доступ к новым исследованиям, открывать особые таланты и наделять рабочую силу новыми умениями, дополнительно расширяя стратегические возможности. Также можно посвятить время удалению камней с ландшафта — ручному процессу, расчищающему землю для дальнейшего расширения территории. Игровой цикл поощряет эксперименты с различными стратегиями и имеет логическое завершение.