Создавайте и развивайте собственную сеть метро в Mini Metro. Город растет, как и количество людей, поток которых перегружает станции. Геймер создает ветки метро между подстанциями, рисуя горизонтальные, вертикальные, диагональные линии, где начинают ездить транспортные средства. Ветки дорог пересекаются исключительно в узлах станций либо под прямым углом. Платформы в игре изображены в качестве пустых квадратов, треугольников, звезд, способных вместить конкретных клиентов. Люди представлены также в виде фигур, которые соответствуют подстанциям.

Режимы симулятора метрополитена:

• Нормальный - на каждой платформе может разместиться определенное число ожидающих персонажей. Нельзя перегружать зал ожидания, иначе будет проигрыш. Необходимо вовремя отправлять пассажиров на поезда.
• Бесконечный - без ограничений по вместимости пассажиров.
• Экстремальный - игрок прокладывает линии метрополитена, которые не подлежат изменениям. Транспортные средства не перемещаются по линиям.
• Ежедневные задачи - новые городки и условия прохождения появляются здесь ежедневно. Завершив прохождение, можно посмотреть рейтинг победителей.
• Креатив - это самостоятельное развитие метрополитена: установка или удаление станций без ограничений в ресурсах.

Симулятор метро состоит из 12 разных уровней, на которых смоделированы реально существующие города - Париж, Лондон, Нью-Йорк, а остальные открываются в процессе. Например, если в одном из мегаполисов суметь перевезти две сотни людей, то открывается Берлин. Особенности каждого города влияют на геймплей: открыв Осаку, можно использовать скоростной транспорт - "Синкансэн", а в Каире в городском транспорте вмещается намного меньше человек.