Цель в Forgotten Fragments — вернуть утерянные артефакты, проходя уровни с головоломками. Под управление геймеров попадают протагонисты Энид, Райдер и Дайен, а основная механика построена на метании сфер. С помощью снарядов необходимо зажигать факелы для завершения этапа. Геймплей совмещает точный платформинг и прицеливание с учётом физики, при этом успешные броски нужно совершить до истечения времени. Это ключевое действие лежит в основе всех испытаний на локациях.

Игра Forgotten Fragments разделена на две полностью самостоятельные кампании с собственным сюжетом и уникальным дизайном локаций. Одиночный режим повествует об истории Энид, собирающей фрагменты. Второй режим предназначен для совместного прохождения вдвоём и предлагает раскрыть иные тайны вместе с напарником. В каждом из них доступно свыше 60 уникальных этапов, распределённых по 4 тематическим мирам, что обеспечивает два полноценных и независимых приключения.

В финале каждого мира игрока ждёт битва с боссом, обладающим уникальными механиками и проверяющим все освоенные ранее навыки. Проект поощряет исследование локаций в поисках скрытого контента. На некоторых из них спрятаны коллекционные предметы, открывающие облики для настройки внешности героев. Также можно отыскать и зажечь особые факелы для доступа к секретным этапам. Все уровни можно проходить повторно для улучшения времени и повышения своих позиций в таблице рекордов.