Spooky Express — логистическая головоломка, разворачивающаяся в пределах жуткого тематического парка, где основной задачей становится безопасная перевозка весьма необычных пассажиров. Человеческим посетителям необходимо добраться до выхода, в то время как разнообразные монстры преследуют свои цели: вампиры стремятся к гробам, а зомби — к могильным ямам. Главная сложность заключается в планировании маршрутов таким образом, чтобы люди не оказались рядом с жуткими попутчиками. В противном случае соседство с чудовищами приведет к тому, что пассажиры будут напуганы или укушены, пополнив ряды нечисти.

Управление этим паранормальным составом возлагается на плечи игрока, выступающего в роли призрачного кондуктора. Каждая из более чем сотни карт представляет собой уникальную задачу по прокладке железнодорожных путей. Пространство для маневра ограничено, поэтому для успешной доставки всех пассажиров по своим пунктам назначения в Spooky Express требуется тщательное стратегическое мышление. Необходимо выстраивать маршруты, решая блочные головоломки и учитывая уникальные правила перемещения для каждого типа существ, чтобы избежать хаоса и выполнить все условия для завершения уровня. Постепенно сложность заданий возрастает, вводя новые механики и виды монстров.