To The Core запускает игровой процесс буром, погружающимся в кору планеты для извлечения ценных материалов. Геймер перемещается по солнечной системе, выбирая из множества процедурно создаваемых планет для начала буровых операций. Каждая экспедиция расходует горючее, превращаясь в ограниченное по времени испытание по сбору как можно большего количества ресурсов до их полного исчерпания.

Успешный рейд завершается возвращением из недр с добычей до того, как в буровой установке кончится топливо, вынуждая совершить обратный рейс. Добытые ресурсы в To The Core затем инвестируются в серию апгрейдов для бурового оборудования. Эти усовершенствования напрямую влияют на ключевые параметры машины, включая её урон, стойкость к подземным угрозам и общую ёмкость топливного бака. Допускается установка дополнительных модификаций, изменяющих функционал установки.

Данная система прокачки является неотъемлемой частью прогресса, ведь каждая следующая планета представляет большую сложность и требует более мощного агрегата для успешной разработки её недр и достижения ядра. Автоматическая система мастерства вознаграждает за длительную добычу конкретных материалов. Когда игрок накапливает определённый ресурс в больших количествах, он получает пассивные бонусы, привязанные к этому типу сырья. Например, собрав 100 единиц железа, можно увеличить шанс выпадения этого металла в будущем в 5 раз. Такая механика в этой игре обеспечивает долгосрочные цели для развития и стимулирует целенаправленно искать определённые ископаемые в ходе многочисленных экспедиций ради получения конкретных преимуществ для своей операции.