Radiant Exodus начинается, когда в небе над Глим-Сити появляются огни, знаменуя начало его распада. Город стремительно погружается во мрак, а его жители бесследно исчезают, оставляя на тротуарах лишь кровавые следы. Игроку предстоит взять под контроль Сару Колдуэлл, бывшую военнослужащую, чья цель — найти пропавшего отца и воссоединиться с другом, оказавшимся в эпицентре этого безумия. Она должна использовать военную подготовку, чтобы передвигаться по разрушающейся городской среде, пока некое присутствие нависает сверху, наблюдая за концом света.

Катастрофа берет свое начало в проекте Эксодус, амбициозной инициативе, предназначенной для переустройства человечества путем создания сверхлюдей. Этот план по формированию высшего вида и спасению цивилизации пошел не так, приведя к противоположному результату. События в тайтле Radiant Exodus ставят вопрос о том, ведет ли выбранный человечеством путь к эволюции или это просто тупиковая ветвь выживания.

Сара вынуждена противостоять безжалостным и искаженным созданиям провального проекта, сражаясь с теми самыми существами, которые должны были олицетворять новое начало. Игровой процесс представляет собой прямолинейное повествование, сфокусированное на напряженном действии и сюжете без отвлечения на второстепенный контент. Боевые сценарии заставляют геймера тщательно управлять ограниченными запасами боеприпасов и сохранять бдительность в столкновениях с упорными противниками. Фрагменты общей картины постепенно раскрываются через найденные записки и перехваченные сообщения, собирая воедино истинные причины коллапса.