Only Up 3 рассказывает о персонаже Джеки, который после подъема через трущобы попадает на космический корабль, летящий к острову Грекко. Оказавшись на новой планете, Джеки сразу же начинает очередное восхождение к небесам. Это закладывает основу для испытания с вертикальным продвижением в непривычном сеттинге. Центральный элемент геймплея состоит в постоянном движении вверх сквозь локации.

Геймер ведет Джеки через череду определенных мест в процессе подъема в Only Up 3. Маршрут пролегает сквозь покинутые деревни, строения с признаками паранормальной активности, безводные пустыни и даже пиратские корабли, находящиеся на высоте тысяч миль. Дальнейшее продвижение открывает военные базы и ожившие египетские пирамиды — все это этапы пути к вершине острова, где может ждать информация о предназначении героя. Базовые действия персонажа включают бег, взбирание на разные объекты и прыжки по платформам.

Механики проекта используют элементы окружения, например, ускорители, расположенные по пути следования. Эти приспособления работают как батуты или открывают короткие срезы для быстрого перемещения. У Джеки также имеется личный ускоритель, дающий возможность двойного прыжка, что помогает преодолевать широкие разрывы. Дизайн этой игры сознательно лишен контрольных точек и системы сохранений, поэтому любое падение может отбросить далеко назад. Достижение самой верхней точки карты является условием для прохождения тайтла.