Return to Mysterious Island 2 продолжает историю героини из первой части. В оригинале Мина оказалась на Таинственном острове после кораблекрушения и неудачно попробовала с него сбежать. В сиквеле девушка предпринимает новую попытку спасения. Ей помогает мартышка по имени Юп. За неё можно играть в продолжении. Юзеру разрешают переключаться между героиней и её питомцем. У персонажей есть уникальные способности. Молодая женщина способна использовать сложные инструменты и читать записки. А обезьяна умеет болтать с сородичами и пробираться в труднодоступные места. Повествование основано на романе Жюля Верна. Однако показанные в игре события происходят спустя 150 лет после завершения сюжета из книги. Сюжетная линия подается в формате комиксов, а не полноценных заставок, как это было раньше.

В официальной русской локализации у проекта более длинное название – Возвращение на таинственный остров II : Судьба Мины. Из нововведений можно отметить появление шкалы, отвечающей за моральное состояние протагонистки и её зверька. Им приходится искать способы подбодрить себя и её компаньона. Как и в предшественнике, перемещение по локациям происходит посредством телепортации между точками с видом от первого лица. Можно всё так же вращать камеру почти на 360 градусов, взаимодействовать с окружением, подбирать, комбинировать и использовать предметы. Геймплей стал более линейным. Частичная нелинейность осталась только в сюжетной линии. Здесь есть 2 концовки. Некоторые старые головоломки перекочевали в продолжение. А у многих новых загадок понизилась сложность. Но среди них попадаются и пазлы, заставляющие игрока поломать голову.