Ys Origin является приквелом к первой и второй части серии. Показанные тут события происходят за 700 лет до оригинала и его сиквела. По понятным причинам здесь не дадут поиграть за Адола Кристина. Так зовут главного героя всех номерных тайтлов в этой франшизе.

В Ys Origin есть три протагониста. У каждого персонажа своя сюжетная линия. Изначально дают выбрать между двумя героями, а третий, секретный боец, разблокируется после первого прохождения. Для полного понимания сюжета потребуется пройти данный проект трижды. С самого начала доступна телохранительница богинь Юника и молодой колдун Хьюго. Девушка не обладает магическими талантами и может драться только в ближнем бою. По сути, она типичный воин (и достаточно шустрый). А медлительный парень предпочитает держаться от врагов на расстоянии, расстреливая их заклинаниями.

Людьми правят богини-близнецы по имени Феена и Рея. Однажды на их земли нападают демоны. Чтобы спасти человечество, сестры собирают всех выживших в Храме Соломона и поднимают его в небеса. Но демонические создания строят Башню Дарма, чтобы продолжить атаку. После этого две божественные родственницы таинственным образом пропадают. Маги и святые рыцари начинают искать их на поверхности.

Проект представляет собой гибрид японской ролевой игры и экшена, причем здесь упор делается в пользу второго жанра. Также присутствуют элементы платформера. Выбранный персонаж носится по башне, прыгает, прокачивается, сражается с монстрами и понимается всё выше. Экипировки тут не так много. Побочные квесты отсутствуют. По ходу игры герой или героиня получает умения. Их можно улучшать с помощью особых камней. Еще есть апгрейд снаряжения, что проводится на точках сохранения. Также присутствуют битвы с боссами. Причем многие главари способны бросить вызов.