Desktop Fishing — это idle-игра, созданная для работы в небольшом окне на экране и запускаемая параллельно с другими задачами на компьютере. В ней персонаж-лягушка самостоятельно ловит рыбу, находит для себя новую одежду и открывает череду различных мест для рыбалки. Основной конфликт заключается в распространении водорослей, что угрожает популяции рыб в мире проекта. Следовательно, главной целью для игрока становится спасение как можно большего числа рыб из этих все более загрязненных вод.

Этот ключевой геймплей продолжается, позволяя добиваться прогресса, не отвлекаясь от других дел. Геймеры могут изменять внешний вид своей лягушки в Desktop Fishing, используя набор одежды, аксессуаров и доступных цветовых палитр. Система кастомизации предоставляет широкий спектр предметов, которые можно комбинировать для изменения облика протагониста. Коллекционный аспект этого тайтла включает более 50 различных видов рыб для поимки и учета. Благодаря элементу случайности, заложенному в рыбалку, можно также вытащить редкие варианты Shiny или даже Holo версии водных существ.

Эти нечастые находки заносятся в коллекцию игрока, отмечая их успешную поимку. По мере прохождения геймеры постепенно получают доступ к ряду разнообразных рыболовных локаций. Эти зоны простираются от первоначального озера до других областей, например, окрестностей вулкана, причем в каждой из них водится уникальный набор рыб. Более того, каждое отдельное место предлагает собственный перечень эксклюзивных предметов для изменения внешности, которые нельзя найти где-либо еще. Эти особые косметические элементы не покупаются, а добываются случайным образом в процессе ловли, добавляя элемент исследования в сбор одежды.