Aeruta начинается после взрыва, вызванного главной героиней, Чаей, что приводит к ее обязательству восстановить пекарню. События разворачиваются в заброшенном городке, где она работает с владелицей магазина Эффи в мире, где выпечка почти забыта. Запах из духовки помогает заново открыть это лакомство, запуская процесс оживления поселения. Чтобы выполнить эту цель, игрок отправляется изучать мир, сражаться с монстрами и добывать ингредиенты, применяя их для преображения города.

Поиск составляющих проходит в формате сражений с боковой прокруткой в нескольких непохожих друг на друга локациях. В проекте Aeruta предлагается несколько видов оружия, каждое из которых обладает веткой умений для формирования уникального стиля игры. Данные зоны таят в себе различные испытания и существ, выступающих источниками редких ресурсов. Уничтожение этих противников — способ добыть сырье для изготовления мучных изделий, а добытые компоненты определяют будущий ассортимент продукции.

В заведении основное внимание смещается на управление лавкой. Геймеру предстоит отвечать за расстановку витрин с товаром, чтобы влиять на итоги продаж и реагировать на запросы посетителей. Деятельность требует поддерживать наличие выпечки на полках и чистоту пола во избежание взысканий. С развитием заведения в городок прибывают новые жители, что открывает свежие перспективы. Процесс подразумевает изучение новых рецептов и улучшение имеющихся для повышения статуса магазина.