The Hundred Line -Last Defense Academy- знакомит геймеров с Такуми Сумино, пареньком, чья обыденная жизнь в Токийском жилом комплексе рушится из-за внезапной катастрофы. Омерзительные монстры атакуют город, сея разрушения и полностью меняя реальность парня. Появляется загадочное создание по имени Сирей, предлагающее ему способ защитить близких, но при этом он должен нанести себе удар в грудь.

Очнувшись после этого, Такуми очутился в изолированной Последней Академии Обороны, окруженной барьером из необычного огня, куда его зачислили вместе с 14 другими студентами в Специальный Отряд Обороны для защиты локации от захватчиков на протяжении сотни дней. Выживание в The Hundred Line -Last Defense Academy- требует выдержать 100-дневную осаду, отражая атаки чудовищных созданий на территорию заведения. Игроку предстоит участвовать в пошаговых тактических сражениях, управляя отрядом студентов в оборонительных боях.

Использование уникальных Специальных Навыков каждого подопечного становится ключом к победе над противниками и обеспечению безопасности академии. Эта затяжная оборона представляет собой отчаянную попытку персонажей вернуть прежнее существование и предотвратить более масштабную угрозу, а сам проект глубоко погружает в темы психологического напряжения и безысходности, порожденные длительным конфликтом. Решения, принимаемые по ходу истории Такуми Сумино, определяют его дальнейшую судьбу и напрямую влияют на финал. Эта игра содержит несколько концовок, подчеркивая весомость выбора в течение всего испытания для студентов.