Morphos — психологический хоррор, в котором грань между реальностью и безумием стирается в стенах таинственного научного комплекса. Исследование мрачных подземных коридоров сопряжено с решением многочисленных головоломок и противостоянием аномальным явлениям. Пространство вокруг постоянно меняется, превращаясь в запутанные лабиринты и искажая привычное восприятие. Выживание потребует скрытного перемещения, грамотного управления ресурсами и использования различных видов оружия для самообороны от монстров. Встречи с противниками и внезапные пугающие события держат в постоянном напряжении, а расставленные повсюду ловушки заставляют действовать предельно осторожно. Геймплей также осложняется временными аномалиями, влияющими на окружение. Сохранить прогресс можно лишь в специальных безопасных комнатах, служащих островком спокойствия.

Сюжетная линия разворачивается вокруг мужчины, недавно покинувшего стены психиатрической лечебницы после потери памяти. Его супруга, учёный-исследователь, устраивает его на работу в свою команду, желая помочь ему вернуться к нормальной жизни и присматривать за ним. Новым местом работы для протагониста в Morphos становится тот самый зловещий подземный объект, где проводятся сомнительные эксперименты. Поначалу происходящее кажется рутиной, однако вскоре начинают твориться необъяснимые вещи. Игроку предстоит не только находить артефакты и ключи для продвижения, но и участвовать в диалогах с возможностью выбора реплик, влияющих на развитие событий. Кульминацией истории становится схватка с чрезвычайно опасным финальным боссом.