В The Black Vault игрок выступает в роли программиста, который пытается попасть в закрытую группу хакеров. Сюжет развивается в течение одной ночи, когда герою приходят задания, требующие взлома серверов и устройств. Выполнение этих миссий связано с необходимостью проникнуть в онлайн-системы для сбора важной информации, при этом сталкиваясь с усиливающимися угрозами со стороны опасных личностей из глубокого интернета.

В проекте The Black Vault геймеру предстоит совмещать наступательные действия с защитой. Сбор данных происходит через изучение скрытых сайтов и взлом удалённых серверов, связанных с группой хакеров. Параллельно необходимо поддерживать безопасность дома, управляя камерами видеонаблюдения, светом и интернет-соединением, чтобы не допустить проникновения нежелательных гостей. Напряжение растёт, когда некоторые злоумышленники реагируют агрессивно и требуют использования средств отпора или скрытного ухода.

Геймплей включает элементы скрытности и стратегии, направленные на выживание. Если определённые противники не боятся отпугивающих мер, геймеру приходится прятаться и избегать столкновений, продолжая выполнение поставленных задач. Такой подход формирует атмосферу, где пользователь постепенно раскрывает детали подпольного мира и рисков, связанных с попытками проникновения. Объединяя взлом, управление ресурсами и скрытность, тайтл представляет собой непрерывное испытание, основанное на вторжении и обороне. Каждое принятое решение влияет на шансы на выживание и продвижение по сюжету. История развивается благодаря умелому балансу между атакой и защитой в условиях нарастающей опасности.