VTuber Connect дарит историю о виртуальных стримерах и отношениях, которые возникают вокруг них. Сюжет рассказывает о Шоме Хасэгаве, студенте, неудовлетворенном общением в первом семестре учебы. Парень находит отдушину в трансляциях Маны, известного VTuber'а с ярким сетевым образом и контентом, привлекаясь к этому цифровому пространству, как и многие другие. Эта визуальная новелла показывает разные пути установления контактов между людьми, в сети и в реальной жизни; игроку предстоит наблюдать за развитием этих связей.

По совету старшей сестры обратить внимание на ценность личного общения, Шома в VTuber Connect знакомится с девушкой вне привычной ему сетевой среды. Эта особа проявляет заметную усталость и делится колкими замечаниями об окружающем мире. Заинтересовавшись ее прямолинейностью, Шома продолжает диалог, что позволяет ему взглянуть на феномен VTuber'ов с иной стороны. Такое взаимодействие подталкивает его к размышлениям о своих мотивах и сути искомых отношений.

Геймер сопровождает Шому в его переживаниях, когда тот контактирует с виртуальной реальностью через Ману и с материальным миром через общение с циничной знакомой. Происходящие события подталкивают героя к оценке различий и сходств между сетевыми аватарами и реальными личностями. Эта игра затрагивает психологические темы убежища, самореализации и природы разных видов связей, с которыми сталкивается персонаж. Весь этот игровой путь заставляет пересмотреть собственные представления о построении близких контактов.