Создатели Shadow Empire решили смешать 4X стратегию, варгейм RPG и элементы рогалика. В этой игре все происходит пошагово. Геймер попадает на опустошенную планету, где многие объекты будут выглядеть для него чужеродно. Он, руководя маленькой нацией, должен завоевать её. Пользователи могут сражаться с компьютером и между собой.

В проекте большой упор делается на процедурную генерацию. Здесь рандомно создаются не только карты, но и технологии, модели юнитов и типы военных формирований. Все стороны конфликта изначально являются отсталыми в плане прогресса. Постепенно они совершенствуют науку и совершают открытия. Изучение технологического древа даст доступ к строительству роботов, генераторов щитов, ядерного оружия, лазерных пушек и другого вооружения.

Император взаимодействует со своими лидерами, которые управляют зонами, прокачиваются и получают навыки (умений тут около 40). Общение с ними выстроено по принципу ролевых игр. Если брезговать их потребностями, то они могут подбить народ на восстание, начать брать взятки или уйти в отставку. В Shadow Empire на подконтрольных юзеру территориях постоянно случаются форс-мажорные события. Например: появление сект или преступных синдикатов. Игроку позволят самому решать, что с ними делать.

В этой TBS нужно много внимания уделять микроменеджменту. Для облегчения этого процесса были введены стратагемы. Их использование дает возможность переложить часть обязанностей главы государства на плечи ИИ. Система дипломатии позволяет заключать пакты о ненападении и давать вассальную присягу. Здесь 100 единиц вооружения и экипировки для бойцов, 30 разновидностей техники. На исход боя между армиями влияет множество факторов. В схватке учитывается мораль солдат, их опыт, способности, готовность к поединку, ландшафт, стойки, вооружение.