Touhou Farming ~ Minoriko's Homestead Harvest ставит перед богиней урожая Минорико Аки задачу увеличить число своих последователей. В мире Гэнсокё среди божеств царит высокая конкуренция, поэтому героиня стремится обеспечивать продуктами растущее Поселение Людей. Её главная цель — накопить веру, служащую мерилом популярности, выращивая различные культуры, включая особый сладкий картофель. Вся эта деятельность ведётся совместно с Храмом Мория, чтобы использовать перемены в регионе в своих интересах.

Геймплей Touhou Farming ~ Minoriko's Homestead Harvest объединяет фермерство, общение с персонажами и исследование мира. Игроку предстоит управлять ресурсами для посадки и сбора урожая, помогающего увеличивать влияние Минорико. Вне усадьбы героиня может посетить курортный город Ясака для общения с другими богами и ёкаями из мифологии этого проекта. Также для изучения доступны окрестности Горы Ёкаев, путешествия по которым могут привести к сражениям с местными обитателями.

Два отдельных игровых режима предлагают разные подходы к менеджменту времени и ресурсов. Казуальный вариант убирает суточные лимиты, позволяя двигаться по сюжету в собственном темпе. Напротив, Серьёзный режим вводит дневной таймер и устанавливает крайний срок в 2 игровых года для выполнения задачи по накоплению веры. Этот вариант также добавляет трудностей в управлении, что требует более тщательного планирования для успеха в заданных условиях.