Funguys Swarm помещает бойца в горящий лес для конфронтации с армией Огненного короля при помощи лесного вооружения и необычных способностей. Предлагается выбор из разнообразных героев, обладающих уникальными умениями для различных боевых подходов. Основная цель игрока — выдерживать непрерывные атаки огненных приспешников и мутировавших овощей, чья интенсивность со временем нарастает. Выживание на арене с видом сверху требует постоянного маневрирования и своевременной ликвидации этих угроз.

В Funguys Swarm продвижение по ходу забега достигается получением многочисленных апгрейдов, складывающихся в хаотичные комбинации мощи. Эти бонусы постепенно превращают выбранного лесного обитателя в грозного оппонента для постоянно растущего роя. Периодически волны врагов прерываются появлением большого, непредсказуемого босса, представляющего собой серьезное испытание. В конце каждого биома ожидает более крупный враг, проверяющий накопленную мощь протагониста и усложняющий игровой процесс.

В перерывах между сражениями геймер развивает центральную локацию, известную как Лесное Святилище. Спасенные создания вносят вклад в развитие этого места, открывая доступ к перманентным усилениям для будущих сессий. Эта игра также включает систему мета-прогрессии, позволяющую постепенно открывать новых персонажей, питомцев, особые навыки и механические костюмы. Данные улучшения обеспечивают долгосрочное преимущество, влияя на стартовые возможности и стратегические опции в начале каждого нового захода.