Mind Diver предлагает геймеру роль следователя, использующего экспериментальные технологии для погружения во фрагментированное подсознание. Главная задача — разобраться в деле об исчезновении человека, путешествуя по Океану Разума женщины по имени Лина. Её память хранит тайны, необходимые для выяснения обстоятельств пропажи её партнёра Себастьяна. В этом ментальном пространстве расследование движется вперёд через анализ искажённых образов и скрытых данных. Процесс требует реконструкции событий, уже недоступных сознанию Лины и формирующих основу всего дела.

Основной геймплей Mind Diver сосредоточен на реконструкции повреждённых воспоминаний, превращая каждое из них в интерактивную головоломку. Любой фрагмент памяти неполон, в нём не хватает ключевой детали, которую игрок должен вычислить и подставить для дальнейшего продвижения. Ответы подчиняются логике, но не лежат на поверхности, требуя находить и правильно толковать улики, собранные в ходе исследования. Это достигается через прослушивание личных бесед и изучение мелких деталей обстановки для установления верных связей. Каждый успешно восстановленный момент открывает новые подробности прошлого, шаг за шагом выстраивая сюжет.

Расследование проливает свет на историю Лины и Себастьяна — пары, чьи отношения зашли в тупик. Лина страдает от потери памяти, а исчезновение Себастьяна, по-видимому, связано со зловещей вечеринкой, скрывающей нечто большее. Мрачная трагедия погребена в области её сознания под названием Вина и является ключевым элементом загадки. Весь этот тайтл представляет собой психологический триллер, посвящённый поиску истины в расколотом разуме. Главная цель игры — восстановить хронологию событий и понять причину эмоционального срыва, лежащего в основе сюжета.