Zombie Graveyard Simulator представляет двойной операционный цикл: днем игроки занимаются захоронениями и кремацией, следят за могилами, удовлетворяют просьбы посетителей и занимаются посевами. С наступлением ночи внимание целиком переключается на оборону от атак ходячих мертвецов, что требует возведения преград для сохранения результатов дневных трудов и собственного спасения. Такая смена деятельности формирует ядро процесса.

В дневное время в Zombie Graveyard Simulator основные обязанности включают подготовку тел покойных и заботу о том, чтобы посетители оставались довольны. Приходящие навещают места упокоения, а содержание участков в чистоте со свежими цветами приносит доход для дела. К этим обязанностям относится и выполнение особых заказов на цветочные аранжировки или памятники. Однако с наступлением темноты обстановка меняется; хотя усопшие лежат спокойно, ожившие мертвецы начинают действовать, их целью становятся недавно погребенные останки и сам игрок.

Чтобы отражать нападения в темное время суток от увеличивающихся орд нежити, среди которых встречаются и особые разновидности, приходится строить оборонительные укрепления. Это могут быть как простые преграды вроде колючей проволоки и оград, так и автоматизированные турели; все это нуждается в своевременной починке и пополнении патронами. В схватках с нечистью применяется арсенал, включающий пистолеты, винтовки, дробовики и надежную лопату. По мере прохождения игры, открывается доступ к новому вооружению, которое можно купить, параллельно совершенствуя боевые умения; контроль за расходом боеприпасов остается важной частью выживания.