Apex Heroines представляет собой трехмерный экшен в научно-фантастическом антураже с идеями трансгуманизма. Игроки берут под контроль героинь, участвуя в схватках с неограниченными уклонениями и бесконечным спринтом. Способности действуют без перезарядки, а оппонентов можно моментально устранять в определенных ситуациях; хотя управление доступно для новичков, продвинутые этапы требуют тактического мастерства и стратегического мышления.

Продвижение в Apex Heroines начинается с одной закрепленной за вами героини. После перехода ко второй основной части тайтла, люди получают возможность свободно выбирать одну из шести доступных героинь. Каждая обладает уникальными чертами и совершенно разными стилями боя, предлагая измененную игровую динамику в зависимости от предпочтений. Основная героиня может использовать пять категорий оружия, и каждый тип даёт особое ощущение от применения и свой метод ведения боя.

Станции смены появляются в локациях, позволяя обменивать текущее вооружение без штрафов. Выбор другого оружия открывает возможность изменить ход событий в сложных ситуациях. Десятки видов рядовых противников и боссов ожидают геймера. Эти враги используют индивидуальные модели поведения, поэтому уровни ставят перед вами разные типы задач. Некоторые сценарии потребуют точности действий и расчета времени, тогда как другие делают упор на планирование и перемещение, оставляя итоговый результат зависящим от ваших решений и поведения.