Fluffy Sailors — это экшен-рогалик, где игроки управляют животными-пиратами в морских сражениях в реальном времени. Бой включает стрельбу членами экипажа как снарядами по вражеским кораблям. Успех позволяет захватывать суда противника. Следовательно, центральной задачей является выполнение королевской миссии Ее Величества. Этот мир населен сферическими, пушистыми животными; участники отправляются в плавание, чтобы спасти повара Мышиной Королевы, удерживаемого аллигаторами. Эти столкновения определяют основной цикл в различных морских локациях. Игрок выступает в роли назначенного защитника для этой операции.

Навигация ведет геймеров через различные островные ландшафты. Здесь они сталкиваются с морскими сражениями против отдельных фракций животных. Однако поражение — это не конец. После проигрыша игроки автоматически возвращаются в Мышиное Королевство. Эта локация служит центром для улучшения навыков перед последующими попытками. Благодаря упорству, т.е. повторению цикла, возможности игрока возрастают. Долгосрочная цель включает достижение господства на морях и преодоление всего сопротивления, встреченного во время спасательной миссии. Продвижение основывается на этом итеративном процессе попыток и улучшений.

Столкновения с врагами предоставляют возможности помимо простого боя. Когда вражеские команды сдаются, их корабли можно захватить. Участники включают эти захваченные суда в свой растущий флот. Эта механика предоставляет доступ к кораблям с различной конструкцией и специфическими сильными сторонами, расширяя тактические возможности. Мышиная Королева назначает игрока своим защитником для этой задачи. Миссия остается ясной: отправиться в плавание, противостоять фракции аллигаторов и вернуть королевского повара. Геймплей вращается вокруг этих морских столкновений и управления флотом.